Câu chuyện bắt đầu vào một thời điểm nào đó sau phần 3 với Valtor (hay Baltor trong phiên bản 4Kids) bị đánh bại và Magical Dimension hiện nay đã an toàn. Bloom và những người bạn của cô quyết định lên đường tìm kiếm bố mẹ của Bloom, Oritel và Marion, khám phá bí mật của vương quốc đã bị lãng quên Domino (còn gọi là Spark, quê hương Bloom), nơi thay đổi cuộc đời của Bloom mãi mãi. Các cô gái tìm gặp Hagen, người thợ rèn đã rèn thanh kiếm của vua Oritel mà được đồn rằng không thể tách rời khỏi chủ nhân của nó. Ông đồng ý giúp, nhưng, sau một chiến dịch nhỏ, Hagen cho rằng ông ta không có cách nào để giúp. Chán nản, Bloom trở về Trái Đất. Rồi một đêm,trong giấc mơ, cô gặp chị cô, Daphne, người trao cho Bloom chiếc mặt nạ giúp Bloom nhìn thấy Domino như trước khi bị tàn phá. Sau đó, họ đến Obsidian Dimension, chạm trán một phù thủy có tên là Mandragora. Bloom phát hiện ra Marion, vợ của Oritel (tức là mẹ của Bloom), đã tự nhốt mình vào thanh kiếm mà Hagen đã chế tạo trước khi bị kẹt vào Obsidian Dimension. Cách duy nhất để cứu cả vương quốc là để cho một vị vua cầm thanh kiếm và khôi phục toàn bộ vương quốc. Điều ngạc nhiên của Bloom là, Sky—người tiết lộ rằng anh đang là một vị vua thực tập của Eraklyon, đã làm được điều này. Bloom cuối cùng đoàn tụ với bố mẹ đẻ và Domino đã được hồi sinh.

Đến đoạn kết của bộ phim, người ta tiết lộ rằng do phá huỷ Obsidian Dimension, the Winx vô tình thả tự do 3 phù thủy cổ xưa. Họ hợp tác với Trix (Icy,Darcy, và Stormy), Họ không xuất hiện vào phần 4 nhưng điều này vẫn có thể đóng một vai trò nhất định trong bộ phim thứ hai (dự kiến vào Giáng Sinh 2009).